Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdc16Q8R349 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdc16Q8R349 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms