Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1U1

Cog4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog4Q8R1U1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cog4Q8R1U1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms