Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Vrk3Q8K3G5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vrk3Q8K3G5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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