Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hacd3Q8K2C9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms