Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Cldn34c1Q8K193 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Cldn34c1Q8K193 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Cldn34c1Q8K193 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Cldn34c1Q8K193 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Cldn34c1Q8K193 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Cldn34c1Q8K193 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Cldn34c1Q8K193 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Cldn34c1Q8K193 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Cldn34c1Q8K193 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Cldn34c1Q8K193 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Cldn34c1Q8K193 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Cldn34c1Q8K193 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn34c1Q8K193 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Cldn34c1Q8K193 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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