Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms