Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rasgef1bQ8JZL7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rasgef1bQ8JZL7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms