Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Card11Q8CIS0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Card11Q8CIS0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Card11Q8CIS0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Card11Q8CIS0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Card11Q8CIS0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Card11Q8CIS0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms