Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh4a1Q8CHT0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms