Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc87Q8CDL9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms