Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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