Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Atg4aQ8C9S8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg4aQ8C9S8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Atg4aQ8C9S8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Atg4aQ8C9S8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg4aQ8C9S8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Atg4aQ8C9S8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Atg4aQ8C9S8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Atg4aQ8C9S8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Atg4aQ8C9S8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Atg4aQ8C9S8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Atg4aQ8C9S8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg4aQ8C9S8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Atg4aQ8C9S8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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