Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccdc159Q8C963 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc159Q8C963 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccdc159Q8C963 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc159Q8C963 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc159Q8C963 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc159Q8C963 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc159Q8C963 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc159Q8C963 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc159Q8C963 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc159Q8C963 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc159Q8C963 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc159Q8C963 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc159Q8C963 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc159Q8C963 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc159Q8C963 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc159Q8C963 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc159Q8C963 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc159Q8C963 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc159Q8C963 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc159Q8C963 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc159Q8C963 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc159Q8C963 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc159Q8C963 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc159Q8C963 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc159Q8C963 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc159Q8C963 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc159Q8C963 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc159Q8C963 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc159Q8C963 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc159Q8C963 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc159Q8C963 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc159Q8C963 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc159Q8C963 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc159Q8C963 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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