Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc90bQ8C3X2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc90bQ8C3X2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc90bQ8C3X2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc90bQ8C3X2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc90bQ8C3X2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc90bQ8C3X2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc90bQ8C3X2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc90bQ8C3X2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc90bQ8C3X2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc90bQ8C3X2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc90bQ8C3X2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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