Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Iffo1Q8BXL9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Iffo1Q8BXL9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Iffo1Q8BXL9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Iffo1Q8BXL9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Iffo1Q8BXL9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Iffo1Q8BXL9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Iffo1Q8BXL9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Iffo1Q8BXL9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Iffo1Q8BXL9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Iffo1Q8BXL9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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