Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp5Q8BX09 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms