Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Usp38Q8BW70 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms