Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Zfp398Q8BV16 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zfp398Q8BV16 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zfp398Q8BV16 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zfp398Q8BV16 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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