Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Suds3Q8BR65 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Suds3Q8BR65 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms