Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efemp1Q8BPB5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms