Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms