Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Clrn3Q8BHH8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Clrn3Q8BHH8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clrn3Q8BHH8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clrn3Q8BHH8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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