Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc38a9Q8BGD6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms