Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms