Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-M10.2Q85ZW9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M10.2Q85ZW9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms