Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms