Protein–RNA interactions for Protein: Q80VL1

Tdrkh, Tudor and KH domain-containing protein, mousemouse

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Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrkhQ80VL1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdrkhQ80VL1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms