Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rpp38Q80UU2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rpp38Q80UU2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rpp38Q80UU2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rpp38Q80UU2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rpp38Q80UU2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpp38Q80UU2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rpp38Q80UU2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rpp38Q80UU2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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