Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp8Q80U87 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp8Q80U87 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp8Q80U87 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp8Q80U87 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp8Q80U87 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp8Q80U87 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp8Q80U87 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp8Q80U87 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp8Q80U87 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp8Q80U87 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp8Q80U87 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp8Q80U87 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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