Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnf1Q7TSH7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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