Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctdp1Q7TSG2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdp1Q7TSG2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms