Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox11Q7M6Y2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms