Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms