Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncapd3Q6ZQK0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms