Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms