Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Podnl1Q6P3Y9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Podnl1Q6P3Y9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Podnl1Q6P3Y9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Podnl1Q6P3Y9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Podnl1Q6P3Y9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Podnl1Q6P3Y9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms