Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnpo3Q6P2B1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnpo3Q6P2B1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms