Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slx4Q6P1D7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slx4Q6P1D7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms