Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms