Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rprd2Q6NXI6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms