Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm4Q6IRU2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm4Q6IRU2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm4Q6IRU2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm4Q6IRU2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm4Q6IRU2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms