Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw2Q6I6G8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw2Q6I6G8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw2Q6I6G8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw2Q6I6G8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw2Q6I6G8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw2Q6I6G8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw2Q6I6G8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw2Q6I6G8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw2Q6I6G8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw2Q6I6G8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw2Q6I6G8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw2Q6I6G8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hecw2Q6I6G8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hecw2Q6I6G8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms