Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Atp11bQ6DFW5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp11bQ6DFW5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp11bQ6DFW5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Atp11bQ6DFW5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Atp11bQ6DFW5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Atp11bQ6DFW5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11bQ6DFW5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11bQ6DFW5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11bQ6DFW5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11bQ6DFW5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11bQ6DFW5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11bQ6DFW5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11bQ6DFW5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11bQ6DFW5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11bQ6DFW5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11bQ6DFW5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11bQ6DFW5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp11bQ6DFW5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms