Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
N4bp1Q6A037 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms