Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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