Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms