Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Knl1Q66JQ7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms