Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp1Q62209 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms