Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttf1Q62187 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttf1Q62187 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttf1Q62187 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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