Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ssr4Q62186 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ssr4Q62186 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ssr4Q62186 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ssr4Q62186 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ssr4Q62186 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ssr4Q62186 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ssr4Q62186 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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